1.脑器质性和躯体疾病 神经衰弱症状常见于各种脑器质性疾病，如脑动脉硬化、颅内占位病变、颅内感染、颅脑损伤后;各种急、慢性工业中毒;以及各种慢性躯体疾病，如肺结核、溃疡病、慢性肝炎、鼻窦炎、甲状腺及肾上腺疾病等。如果神经衰弱症状发生于上述疾病之后，则应诊断为上述相应的脑或躯体疾病。
2.重性精神病 神经衰弱症状可见于精神分裂症和抑郁症等重性精神病的早期、病程中和缓解期。这类患者早期可有神经衰弱症状，往往不主动关心自己的健康，不积极要求治疗，并有相应的精神病性症状存在，可资鉴别。
3.其他神经症性障碍 神经衰弱症状也常见于焦虑障碍、恶劣心境、躯体化障碍、疑病症等。如果患者有这类疾病的典型症状，按等级制诊断原则，不再诊断为神经衰弱，而诊断为各种相应的疾病。
这里需特别提到适应不良问题，尤其是大学生远离家乡、亲人，学习方法与中学不同，生活环境也不一样。特别在寄宿制学生中，对集体生活感到很不习惯，发生类似神经衰弱症状群，其实都是适应不良。以往对适应不良认识不足，颇多被诊断为神经衰弱。有些患者到处求医、服药，但效果不佳，而经心理治疗，短程心理分析，疗效显著。
4.疲劳反应 正常人在脑力或体力过度劳累之后，常会产生疲劳反应，出现头痛、头昏、嗜睡、精力不足、注意力不集中、失眠、或烦躁、易怒等症状。但这些症状历时短暂，引起疲劳的因素消除后，经过充分休息，即可迅速恢复常态;一般并不引起患者过分烦恼或不愉快的情感体验。如果工作负担已减轻，适当休息之后，上述症状仍持续存在，或时轻时重，迁延不愈，达3个月以上者，则应诊断为神经衰弱。在流行学调查时，除要求符合症状学标准和严重程度标准外，病程必须持续达3个月以上，对排除其他疾病是非常重要的。
5.慢性疲劳综合征 慢性疲劳综合征(chronic fatigue syndrome)这是美国疾病控制中心(Centers for Disease Control，CDC)建议使用于一类病因未明，以慢性疲劳为特征的综合病征的名称。该综合征的诊断标准如下：
主要标准：①新近起病的严重而虚弱性疲劳，持续至少6个月;②没有发现引起疲劳的内科或精神科疾病。
次要标准：包括广泛的头痛，肌痛，关节痛，发热，咽痛，淋巴结痛，肌无力，活动后持久的疲劳，神经心理症状(如易激惹、健忘、注意力不集中、思维困难、抑郁等)，睡眠障碍，突然发生的疲劳等。(要求至少有其中8项症状)。
客观标准：包括低热(口表37.6～38.0℃或肛表37.9～38.8℃)，非渗出性咽炎，颈前或腋下淋巴结长大、触痛。
这类疾病被疑为Epstein-Barr病毒感染或免疫异常。由于有低热、咽痛及淋巴结长大等客观体征，因而与神经衰弱有别。
由于神经衰弱的许多症状，颇多与焦虑障碍或抑郁性神经症或隐匿型抑郁症相似，在临床上应首先排除抑郁与焦虑性障碍，并从症状演变、治疗效果来判断，避免把神经衰弱当作“垃圾箱”。还要与精神分裂症的早期症状、颅脑外伤后综合征、适应不良及过度疲劳区别。过度疲劳引起疲乏无力、头昏脑涨、注意力不能集中等症状，经休息后即可恢复。
本病患者有显著的衰弱或持久的疲劳症状，但无躯体疾病或脑器质性病变可以解释这类症状发生的原因;加上本病常有的易兴奋又易疲劳(兴奋性衰弱)，情绪症状、紧张性疼痛和睡眠障碍这4类症状中的任何两项;对学习、工作和社会交往造成了不良影响;疗程在3个月以上;排除了其他神经症性障碍和精神病的可能，便可诊断为神经衰弱。或者依据下列临床表现：
1.衰弱症状 如精神疲乏，脑力迟钝，注意力难集中，记忆困难，工作和学习不能持久，效率减低。
2.兴奋症状 工作或学习时用脑均可引起精神兴奋，回忆及联想增多且控制不住，对声、光敏感，但并不表现言语行动增多。
3.情绪症状 易烦恼、易激惹，也可表现在工作、学习效率下降或精力不足时焦虑、苦恼，但并无广泛的焦虑或原因不明的心境低落。
4.紧张性疼痛 如紧张性肌肉疼痛。
5.睡眠障碍 如入睡困难、多梦、易醒，睡后仍有疲乏感。至少具上述5项症状中的3项，且无躯体疾病或脑器质性病变可以解释这类症状发生的原因，并需经一定时间的观察(如2～3个月)或病程在3个月以上，即可诊断神经衰弱。
