(1)肾结核及肾肿瘤 肾结核及肾肿瘤可有肾区疼痛及压痛、镜下血尿等临床症状，应与肾及输尿管结石相鉴别，前者很少有绞痛，B超及X线检查可助鉴别。 (2)急性阑尾炎 右侧输尿管结石时的右下腹部疼痛易与阑尾炎混淆，需鉴别。急性阑尾炎时腹痛有像结石那样严重且呈持续性，局部有压痛、反跳痛和肌紧张，可有发热及白细胞计数升高，尿液检查可无红细胞，B超和X线检查可无结石阴影。可与前者鉴别。 (3)胆石症 右肾结石需与胆石症相鉴别，胆结石主要是右上腹痛且向右肩和背部放射，B超及胆囊造影可发现结石阴影，可助鉴别。 (4)急性肾盂肾炎 急性肾盂肾炎可有血尿，应与肾及输尿管结石相鉴别，但前者有发热等中毒症状，B超及X线检查可助鉴别。
主要症状是疼痛和血尿，极少数病人可长期无自觉症状。 (一)疼痛：大部分患者出现腰痛或腹部疼痛。较大的结石，多为患侧腰部钝痛或隐痛，常在活动后加重;较小的结石，多引起平滑肌痉挛而出现绞痛，这种绞痛常突然发生，疼痛剧烈，如刀割样，向下腹部、外阴部和大腿内侧放射。有时患者伴有面色苍白、出冷汗、恶心、呕吐，严重者出现脉弱而快、血压下降等症状。疼痛常阵发性发作，或可因某个动作疼痛突然终止或缓解，遗有腰、腹部隐痛。 (二)血尿：由于结石直接损伤肾和输尿管的粘膜，常在剧痛后出现镜下血尿或肉眼血尿，血尿的严重程度与损伤程度有关。 (三)脓尿：肾和输尿管结石并发感染时尿中出现脓细胞，临床可出现高热、腰痛。 (四)其它：结石梗阻可引起肾积水、肾功能不全，有的病人尚可出现胃肠道症状，贫血等等。
