鉴别诊断主要包括：①早期膜性肾病应与轻微病变或局灶性肾小球硬化鉴别，有时在光镜下不能区别，主要靠电镜检查。②除外其他继发性原因所致的膜性肾病，原发性膜性肾病一般不伴明显细胞增生。怀疑系统性红斑狼疮者，可查ANA、抗ds-DNA抗体、Sm抗体、RNP及血清补体等，并结合临床表现进行鉴别;乙肝相关性膜性肾病：除乙肝病史及血清免疫学标记外，主要靠肾组织中发现HBsAg免疫复合物沉积或HBV— DNA。60岁以上的老年人表现为难治性肾病综合征，应作各种有关影像学检查，以除外恶性肿瘤相关性膜性。肾病。③有否合并症：如在临床上出现肺栓塞、急性腰腹痛、难以解释的血尿、蛋白尿增加、急性肾功能损害伴单或双侧肾体积增大等，应高度怀疑肾静脉血栓形成，并作计算机断层扫描(CT)、B超或多普勒超声血流图、肾静脉造影术等检查。目前临床上应用最广的是经皮股静脉穿刺选择性肾静脉造影术，若发现血管充盈缺损或静脉分支不显影即可确诊。若仅观察到某一局部造影剂引流延迟也应怀疑该部位有小血栓存在。慢性型尤其发生在左肾时，有时还能见到侧支循环。
表现为突然出现的腰痛，常较剧烈，伴肾区叩击痛。尿蛋白突然增加，常出现肉眼血尿、白细胞尿、高血压及急性肾功能损害，B超见病侧肾脏增大。双侧肾静脉血栓形成可致少尿和急性肾衰。