1.肛裂：肛管狭窄的病人，由于肛管瘢痕增生，使皮肤失去弹性，大便通过时撕裂皮肤而形成裂口，易与肛裂相混。局部检查时可见，肛裂之裂口较深，周围皮肤弹性正常，而肛管狭窄所致之裂口较浅，周围皮肤弹性较差，肛管狭窄，鉴别较容易。
2.肛管鳞状细胞癌：肛管鳞状细胞癌与肛管狭窄的临床表现相近，可通过病理学检查鉴别。
3.性病性淋巴肉芽肿：性病性淋巴肉芽肿也能引起肛管狭窄，其表现与肛门狭窄近似，但其有冶游史，腹股沟、淋巴结肿大，弗莱氏试验阳性，以资鉴别。
(一)症状：主要症状是粪便细及排便困难，如有感染或溃疡并存时则有疼痛。
1.排便困难：先天性肛管狭窄和后天性肛管狭窄均表现为：大便困难，粪便变细变扁或仅排出少量稀粪，排便次数增多。
2.疼痛：便时和便后肛门疼痛，大便时带血，可伴有肛门坠胀，里急后重，灼热，异物感等感觉。
3.其它：有的患者可伴有肛门失禁，腹胀不适等症状。
(二)体征：由于分泌物的刺激，出现肛周皮肤的改变，表皮脱落，表浅裂口，或见肛门畸形。
