与大阴唇、腹股沟疝鉴别：疝与腹股沟环相连，挤压时可以复位消失，咳嗽时感觉肿块冲动，向下屏气时肿块稍胀大，叩之有鼓音，在过度使力时，常突然出现。
还应与前庭大腺炎、子宫内膜异位囊肿、尿道旁腺脓肿、淋巴水肿相鉴别。
前庭大腺囊肿大小不等，多由小逐渐增大，生长缓慢，有些可持续数年不变。多为单发，一般不超过鸡蛋大小，极少双侧同时发生。若囊肿小且无感染，患者可无自觉症状，往往于妇科检查时方被发现。若囊肿大，患者可感到外阴有坠胀感和膨胀感或有性交不适。
检查见囊肿多为单侧，也可为双侧。检查表皮外观正常，囊肿位于阴唇后下方和阴唇系带之间的前庭大腺所在处，呈半月形、卵圆形或圆形，囊肿在大阴唇外侧明显隆起，患侧小阴唇被展平。囊肿有移动性，无明显触痛。性生活频繁时，囊肿迅速增大。继发感染时，局部红肿、疼痛明显，患者有发热等全身症状，囊肿可发展为脓肿。
育龄期妇女出现的单侧大阴唇下端囊性肿物，无明显自觉症状，穿刺有黏液，性刺激对其大小有影响是其特点。病理检查可确诊。从囊肿所在的部位及外观或局部无炎症征象等特点，一般不难诊断。必要时可行局部穿刺，其内容物可与前庭大腺炎及脓肿、淋巴水肿等鉴别。
