1、类风湿性关节炎：其关节炎表现甚至X线表现均与本征有相似之处，故Cecil曾将Reiter综合征列入类风湿性关节炎的临床异型中。但一般类风湿关节炎不会同时出现尿道，结膜炎及皮肤粘膜损害。
2、强直性脊柱炎：本征慢性脊柱病变患者必须与强直性脊柱炎相鉴别，两者眼症和X线表现无较大差异，但如先有关节周围炎伴有尿道炎史，特别有溢脓性卡他性皮肤角化病表现，则支持Reiter综合征。
3、淋病性关节炎：淋球菌性关节炎只限于滑膜;不侵犯关节，故关节液淋球菌培养阴性，但尿道脓性分泌物培养阳性，而本征则查不到淋病双球菌。本征虽有环状龟头炎，但不同志淋病的包皮龟头炎及尿道口红肿表现，本征皮肤损害以及溢脓性皮肤角化病为物特征，淋病则以血管脓疱性皮肤病为特征。
4、脓疱型银屑病：脓疱型银屑病与Reiter综合征的溢脓性皮肤角化病，两者之间在临床和组织学都十分相似，如银屑病累及结膜，则更容量混淆，但银屑病无尿道炎和痢疾史。
5、白塞综合征：Reiter综合征有尿道炎和关节炎，而白塞综合征则无。本征口腔和阴部损害是水疱破溃后糜烂并结痂，而白塞病则为较深的溃疡。本征极少发生于女性，而后者则女性多见。本征在我国少见，而白塞病并不少见。
女性Reiter综合征很少见，女阴皮肤及粘膜皮疹更少见。Edwards(1992)报道1例女性患者，开始指尖发红、压痛及甲分离，并有阴道分泌物、粘膜损害及腋下脓疱，白色念珠菌培养阳性。4年后出现阴道分泌物，伴有无痛性口腔溃疡，随后女阴、会阴出现红色结痂斑块。经MTX治疗后皮肤病变逐步消退，但减量后皮疹复发，女阴部皮肤出现粉红色鳞屑性丘疹，直径1～2mm，境界清楚，小阴唇及前庭也有散在的白色圆形及环形丘疹，边缘清楚，直径约2～4mm。整个外生殖均可见散在性界限清楚、顶端糜烂性丘疹。皮肤及小阴唇活检符合Reiter综合征。
辅助检查：
1、外围血白细胞计数常升高一般为(10～18)×109/L(10 000～18 000/mm3)，个别可超过20×109/L(20 000/mm3)，有少数病例白细胞计数不升高;病程较长者可有贫血;多数病例血沉增快。
2、尿道分泌物含有大量白细胞，多为多核白细胞，常出现脓尿，也可见血尿。
3、滑膜液混浊，一些病例呈明显脓性，白细胞计数常为(2～5)×109/L(2000～5000/mm3)，偶可高达10～×109/L，早期大部份为多核白细胞，炎症反应消退时比例下降，而变成以淋巴细胞为主，滑液中糖含量正常，但在白细胞数量特别高时，糖含量可降低，滑液补体水平通常巴细胞为主，滑液中糖含量正常，但在白细胞数量特别高时糖含量可降低，滑液补体水平通常比其他渗出液高，蛋白含量增高，蛋白补体结合率与关节变性、风湿和类风湿性关节炎相似。
4、尿道、前列腺分泌物淋球菌培养阴性，血和浆液中未查见细菌，结膜渗出液无菌或只有非致病菌。
5、白细胞组织相容抗原HLA-B27大多阳性。
